退職し、家庭中心の生活を送っていたブースとブレナン。ところがある日、ブースの遺体が見つかったという知らせが入り、ブレナンはジェファソニアンに駆けつける。
南北戦争体験場で、男性歯科医の白骨死体が発見される。ゲイの元恋人や歯科衛生士など複数の容疑者が浮かび上がるが…。一方、ブースの弟が突然現れ、出会って間もない女性と結婚すると言う。
モサドのマイケル・リフキンが現れたことで、トニーはジヴァにNCISへの忠誠心を問う必要に迫られる。
エイダンの調査で母がゴードンと夫婦関係にあったことを知ったエミリーは、“死んだ父のための復讐”に再び目覚めていた。そこでグレイソン・グローバル社の内部調査を行うようエイダンを送り込むと、社が危機的状況に置かれていることが判明。そんな中、アマンダの正体を追う伝記作家メイソンが突然病室へやって来る。
キャッツキルの隠れ家にいたヴィクトリアは“白髪の男”の手を借り、娘シャーロットと共に国外逃亡を図ろうとしていた。しかし事態は一転。監視カメラでヴィクトリアの日常を見張るエミリーは、計画を阻止しようとある裏取引に動いていた。窮地に追いやられたヴィクトリアは、コンラッドと共謀。警察に連絡すると「“白髪の男”に誘拐され、暴行されていた」と証言し公の場に姿を現す。